python 将dicom图片转换成jpg图片的实例

yipeiwu_com6年前Python基础

主要原理:调整dicom的窗宽,使之各个像素点上的灰度值缩放至[0,255]范围内。

使用到的python库:SimpleITK

下面是一个将dicom(.dcm)图片转换成jpg图片的demo:

import SimpleITK as sitk
import numpy as np
import cv2

def convert_from_dicom_to_jpg(img,low_window,high_window,save_path):
  lungwin = np.array([low_window*1.,high_window*1.])
  newimg = (img-lungwin[0])/(lungwin[1]-lungwin[0])  #归一化
  newimg = (newimg*255).astype('uint8')        #将像素值扩展到[0,255]
  cv2.imwrite(save_path, newimg, [int(cv2.IMWRITE_JPEG_QUALITY), 100])

if __name__ == '__main__':

  # 下面是将对应的dicom格式的图片转成jpg
  dcm_image_path = '/DICOM_image/lung001.dcm'    #读取dicom文件
  output_jpg_path = 'JPG_image/lung001.jpg'
  ds_array = sitk.ReadImage(dcm_image_path)     #读取dicom文件的相关信息
  img_array = sitk.GetArrayFromImage(ds_array)   #获取array
  # SimpleITK读取的图像数据的坐标顺序为zyx,即从多少张切片到单张切片的宽和高,此处我们读取单张,因此img_array的shape
  #类似于 (1,height,width)的形式
  shape = img_array.shape
  img_array = np.reshape(img_array, (shape[1], shape[2])) #获取array中的height和width
  high = np.max(img_array)
  low = np.min(img_array)
  convert_from_dicom_to_jpg(img_array, low, high, output_jpg_path)  #调用函数,转换成jpg文件并保存到对应的路径
  print('FINISHED')

以上这篇python 将dicom图片转换成jpg图片的实例就是小编分享给大家的全部内容了,希望能给大家一个参考,也希望大家多多支持【听图阁-专注于Python设计】。

相关文章

django使用html模板减少代码代码解析

django使用html模板减少代码代码解析

看下面两个页面: 一个显示文章列表,一个显示文章详细信息,其中的部分内容相同,有可以重用的部分。 所有就此例可以设置三个html文件:重用部分,目录部分,文章部分。 重用部分: ba...

解决Django中多条件查询的问题

tags: django中对条件查询 一些cms项目都会使用到多条件查询,我们后端如何处理请求的条件呢? 满足一个条件 满足两个条件 满足多个条件 …………………. 这样处理起来...

Python判断一个文件夹内哪些文件是图片的实例

如下所示: def is_img(ext): ext = ext.lower() if ext == '.jpg': return True elif ext == '.p...

python对list中的每个元素进行某种操作的方法

如下所示: ''' 对列表中的每个元素进行某种操作 ''' def add(c): return c**2 l = [1,2,3] d1 = map(add,l) print d...

详解Django的CSRF认证实现

详解Django的CSRF认证实现

什么是 CSRF CSRF, Cross Site Request Forgery, 跨站点伪造请求。举例来讲,某个恶意的网站上有一个指向你的网站的链接,如果某个用户已经登录到你的网站...