Python可视化mhd格式和raw格式的医学图像并保存的方法

yipeiwu_com5年前Python基础

mhd格式的文件里面包含的是raw图像的一些头信息,比如图片大小,拍摄日期等等,那么如何可视化图像呢?

import cv2
import SimpleITK as sitk
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
image =sitk.ReadImage(path)
image = sitk.GetArrayFromImage(image)
#image = np.squeeze(image[slice, ...]) # if the image is 3d, the slice is integer
plt.imshow(image,cmap='gray')
plt.axis('off')
plt.show()
cv2.imwrite('1.png',image)

这里path是mhd文件的路径,并且在该路径下需要有相应的raw文件

这里展示一下我的mdk文件和保存的png文件

Python可视化mhd格式和raw格式的医学图像并保存

Python可视化mhd格式和raw格式的医学图像并保存

在这里如果cv2和ITK模块没有的话可以用pip安装

pip install opencv-python 
pip install SimpleITK

以上这篇Python可视化mhd格式和raw格式的医学图像并保存的方法就是小编分享给大家的全部内容了,希望能给大家一个参考,也希望大家多多支持【听图阁-专注于Python设计】。

相关文章

python合并同类型excel表格的方法

本文实例为大家分享了python合并同类型excel表格的具体代码,供大家参考,具体内容如下 python脚本如下,验证有效。 #!/usr/bin/env python # -...

DataFrame 将某列数据转为数组的方法

如下所示: playerIds =salaries_2016['playerID'].tolist() data['列名'].tolist() 以上这篇DataFrame 将某列...

python如何求解两数的最大公约数

题目: 给定两个自然数,求这两个数的最大公约数。 分析: 单看题目的话,非常简单,我们可以循环遍历自然数,如果能够整除两个自然数,就把这个数记下来,在这些记录中找到最大的一个。 但...

浅析Python中else语句块的使用技巧

浅析Python中else语句块的使用技巧

学过C/C++的都知道,else语句是和if语句搭配使用的,但是在Python中,else语句更像是作为一个模块,不仅仅可以和if语句搭配,还可以和循环语句,异常处理语句搭配使用。 下面...

python-numpy-指数分布实例详解

如下所示: # Seed random number generator np.random.seed(42) # Compute mean no-hitter time: ta...