Python可视化mhd格式和raw格式的医学图像并保存的方法

yipeiwu_com6年前Python基础

mhd格式的文件里面包含的是raw图像的一些头信息,比如图片大小,拍摄日期等等,那么如何可视化图像呢?

import cv2
import SimpleITK as sitk
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
image =sitk.ReadImage(path)
image = sitk.GetArrayFromImage(image)
#image = np.squeeze(image[slice, ...]) # if the image is 3d, the slice is integer
plt.imshow(image,cmap='gray')
plt.axis('off')
plt.show()
cv2.imwrite('1.png',image)

这里path是mhd文件的路径,并且在该路径下需要有相应的raw文件

这里展示一下我的mdk文件和保存的png文件

Python可视化mhd格式和raw格式的医学图像并保存

Python可视化mhd格式和raw格式的医学图像并保存

在这里如果cv2和ITK模块没有的话可以用pip安装

pip install opencv-python 
pip install SimpleITK

以上这篇Python可视化mhd格式和raw格式的医学图像并保存的方法就是小编分享给大家的全部内容了,希望能给大家一个参考,也希望大家多多支持【听图阁-专注于Python设计】。

相关文章

多版本Python共存的配置方法

多版本Python共存的配置方法

同一台PC中,如果同时安装Python2和Python3环境,会在执行python命令时出现错误,操作系统会找到默认的配置进行执行。怎么样才能让python2和python3一起工作又互...

selenium3+python3环境搭建教程图解

selenium3+python3环境搭建教程图解

1、首先安装火狐浏览器 有单独文章分享怎么安装 2、搭建python环境 安装python,安装的时候把path选好,就不用自己在配置,安装方法有单独文档分享 安装好以后cmd打开输入p...

学习Python3 Dlib19.7进行人脸面部识别

学习Python3 Dlib19.7进行人脸面部识别

0.引言 自己在下载dlib官网给的example代码时,一开始不知道怎么使用,在一番摸索之后弄明白怎么使用了; 现分享下 face_detector.py 和&n...

python2.7+selenium2实现淘宝滑块自动认证功能

python2.7+selenium2实现淘宝滑块自动认证功能

本文为大家分享了python2.7+selenium2实现淘宝滑块自动认证的具体代码,供大家参考,具体内容如下 1.编译环境 操作系统:win7;语言:python2.7+selen...

忘记ftp密码使用python ftplib库暴力破解密码的方法示例

python具体强大的库文件,很多功能都有相应的库文件,所以很有必要进行学习一下,其中有一个ftp相应的库文件ftplib,我们只需要其中的登录功能,然后利用多线程调用相应字典里面的字段...