Python可视化mhd格式和raw格式的医学图像并保存的方法

yipeiwu_com6年前Python基础

mhd格式的文件里面包含的是raw图像的一些头信息,比如图片大小,拍摄日期等等,那么如何可视化图像呢?

import cv2
import SimpleITK as sitk
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
image =sitk.ReadImage(path)
image = sitk.GetArrayFromImage(image)
#image = np.squeeze(image[slice, ...]) # if the image is 3d, the slice is integer
plt.imshow(image,cmap='gray')
plt.axis('off')
plt.show()
cv2.imwrite('1.png',image)

这里path是mhd文件的路径,并且在该路径下需要有相应的raw文件

这里展示一下我的mdk文件和保存的png文件

Python可视化mhd格式和raw格式的医学图像并保存

Python可视化mhd格式和raw格式的医学图像并保存

在这里如果cv2和ITK模块没有的话可以用pip安装

pip install opencv-python 
pip install SimpleITK

以上这篇Python可视化mhd格式和raw格式的医学图像并保存的方法就是小编分享给大家的全部内容了,希望能给大家一个参考,也希望大家多多支持【听图阁-专注于Python设计】。

相关文章

python通过tcp发送xml报文的方法

如下所示: # -*- coding: utf-8 -*- import socket # 使用tcp发送请求报文 def tcpsend(ip, port, xmlbw): ad...

Python实现将数据写入netCDF4中的方法示例

本文实例讲述了Python实现将数据写入netCDF4中的方法。分享给大家供大家参考,具体如下: nc文件为处理气象数据文件。用户可以去https://www.lfd.uci.edu/~...

Python字符串中查找子串小技巧

惭愧啊,今天写了个查找子串的Python程序被BS了… 如果让你写一个程序检查字符串s2中是不是包含有s1。也许你会很直观的写下下面的代码: 复制代码 代码如下: #determine...

布同 统计英文单词的个数的python代码

word中对于英文单词的统计也很好,大家不妨试试。如果没有安装word,而且你也是程序员的话,那么可以使用我的这段代码。通过测试,word的统计结果是18674,软件的统计结果是1834...

Python实现list反转实例汇总

本文实例总结了Python实现list反转的方法。分享给大家供大家参考。具体实现方法如下: 下面有几个不同实现的函数 复制代码 代码如下:import math   def r...