Python科学计算之Pandas详解
起步
Pandas最初被作为金融数据分析工具而开发出来，因此 pandas 为时间序列分析提供了很好的支持。 Pandas 的名称来自于面板数据（panel data）和python数据分析 （data analysis） 。panel data是经济学中关于多维数据集的一个术语，在Pandas中也提供了panel的数据类型。
在我看来，对于 Numpy 以及 Matplotlib ，Pandas可以帮助创建一个非常牢固的用于数据挖掘与分析的基础。而Scipy当然是另一个主要的也十分出色的科学计算库。
安装与导入
通过pip进行安装: pip install pandas
导入：
import pandas as pd
Pandas的数据类型
Pandas基于两种数据类型： series 与 dataframe 。
Series
一个series是一个一维的数据类型，其中每一个元素都有一个标签。类似于Numpy中元素带标签的数组。其中，标签可以是数字或者字符串。
# coding: utf-8 import numpy as np import pandas as pd s = pd.Series([1, 2, 5, np.nan, 6, 8]) print s
输出：
0 1.0 1 2.0 2 5.0 3 NaN 4 6.0 5 8.0 dtype: float64
DataFrame
一个dataframe是一个二维的表结构。Pandas的dataframe可以存储许多种不同的数据类型，并且每一个坐标轴都有自己的标签。你可以把它想象成一个series的字典项。
创建一个 DateFrame：
#创建日期索引序列
dates = pd.date_range('20130101', periods=6)
#创建Dataframe，其中 index 决定索引序列，columns 决定列名
df = pd.DataFrame(np.random.randn(6,4), index=dates, columns=list('ABCD'))
print df
输出：
A B C D 2013-01-01 -0.334482 0.746019 -2.205026 -0.803878 2013-01-02 2.007879 1.559073 -0.527997 0.950946 2013-01-03 -1.053796 0.438214 -0.027664 0.018537 2013-01-04 -0.208744 -0.725155 -0.395226 -0.268529 2013-01-05 0.080822 -1.215433 -0.785030 0.977654 2013-01-06 -0.126459 0.426328 -0.474553 -1.968056
字典创建 DataFrame
df2 = pd.DataFrame({ 'A' : 1.,
'B' : pd.Timestamp('20130102'),
'C' : pd.Series(1,index=list(range(4)),dtype='float32'),
'D' : np.array([3] * 4,dtype='int32'),
'E' : pd.Categorical(["test","train","test","train"]),
'F' : 'foo' })
输出：
A B C D E F 0 1 2013-01-02 1 3 test foo 1 1 2013-01-02 1 3 train foo 2 1 2013-01-02 1 3 test foo 3 1 2013-01-02 1 3 train foo
将文件数据导入Pandas
df = pd.read_csv("Average_Daily_Traffic_Counts.csv", header = 0)
df.head()
数据源可以是 英国政府数据 或 美国政府数据 来获取数据源。当然， Kaggle 是另一个好用的数据源。
选择/切片
# 选择单独的一列，返回 Serires，与 df.A 效果相当。 df['A'] # 位置切片 df[0:3] # 索引切片 df['20130102':'20130104'] # 通过标签选择 df.loc[dates[0]] # 对多个轴同时通过标签进行选择 df.loc[:,['A','B']] # 获得某一个单元的数据 df.loc[dates[0],'A'] # 或者 df.at[dates[0],'A'] # 速度更快的做法 # 通过位置进行选择 df.iloc[3] # 切片 df.iloc[3:5,0:2] # 列表选择 df.iloc[[1,2,4],[0,2]] # 获得某一个单元的数据 df.iloc[1,1] # 或者 df.iat[1,1] # 更快的做法 # 布尔索引 df[df.A > 0] # 获得大于零的项的数值 df[df > 0] # isin 过滤 df2[df2['E'].isin(['two','four'])]
赋值
# 新增一列，根据索引排列
s1 = pd.Series([1,2,3,4,5,6], index=pd.date_range('20130102', periods=6))
df['F'] = s1
# 缺省项
# 在 pandas 中使用 np.nan 作为缺省项的值。
df1 = df.reindex(index=dates[0:4], columns=list(df.columns) + ['E'])
df1.loc[dates[0]:dates[1],'E'] = 1
# 删除所有带有缺省项的行
df1.dropna(how='any')
# 填充缺省项
df1.fillna(value=5)
# 获得缺省项的布尔掩码
pd.isnull(df1)
观察操作
# 观察开头的数据 df.head() # 观察末尾的数据 df.tail(3) # 显示索引 df.index # 显示列 df.columns # 显示底层 numpy 结构 df.values # DataFrame 的基本统计学属性预览 df.describe() """ A B C D count 6.000000 6.000000 6.000000 6.000000 #数量 mean 0.073711 -0.431125 -0.687758 -0.233103 #平均值 std 0.843157 0.922818 0.779887 0.973118 #标准差 min -0.861849 -2.104569 -1.509059 -1.135632 #最小值 25% -0.611510 -0.600794 -1.368714 -1.076610 #正态分布 25% 50% 0.022070 -0.228039 -0.767252 -0.386188 #正态分布 50% 75% 0.658444 0.041933 -0.034326 0.461706 #正态分布 75% max 1.212112 0.567020 0.276232 1.071804 #最大值 """ # 转置 df.T # 根据某一轴的索引进行排序 df.sort_index(axis=1, ascending=False) # 根据某一列的数值进行排序 df.sort(columns='B')
统计
# 求平均值 df.mean() """ A -0.004474 B -0.383981 C -0.687758 D 5.000000 F 3.000000 dtype: float64 """ # 指定轴上的平均值 df.mean(1) # 不同维度的 pandas 对象也可以做运算，它会自动进行对应，shift 用来做对齐操作。 s = pd.Series([1,3,5,np.nan,6,8], index=dates).shift(2) """ 2013-01-01 NaN 2013-01-02 NaN 2013-01-03 1 2013-01-04 3 2013-01-05 5 2013-01-06 NaN Freq: D, dtype: float64 """ # 对不同维度的 pandas 对象进行减法操作 df.sub(s, axis='index') """ A B C D F 2013-01-01 NaN NaN NaN NaN NaN 2013-01-02 NaN NaN NaN NaN NaN 2013-01-03 -1.861849 -3.104569 -1.494929 4 1 2013-01-04 -2.278445 -3.706771 -4.039575 2 0 2013-01-05 -5.424972 -4.432980 -4.723768 0 -1 2013-01-06 NaN NaN NaN NaN NaN """
函数应用
# 累加 df.apply(np.cumsum)
直方图
s = pd.Series(np.random.randint(0, 7, size=10)) s.value_counts() """ 4 5 6 2 2 2 1 1 dtype: int64 String Methods """
字符处理
s = pd.Series(['A', 'B', 'C', 'Aaba', 'Baca', np.nan, 'CABA', 'dog', 'cat']) s.str.lower() """ 0 a 1 b 2 c 3 aaba 4 baca 5 NaN 6 caba 7 dog 8 cat dtype: object """
合并
使用 concat() 连接 pandas 对象:
df = pd.DataFrame(np.random.randn(10, 4)) """ 0 1 2 3 0 -0.548702 1.467327 -1.015962 -0.483075 1 1.637550 -1.217659 -0.291519 -1.745505 2 -0.263952 0.991460 -0.919069 0.266046 3 -0.709661 1.669052 1.037882 -1.705775 4 -0.919854 -0.042379 1.247642 -0.009920 5 0.290213 0.495767 0.362949 1.548106 6 -1.131345 -0.089329 0.337863 -0.945867 7 -0.932132 1.956030 0.017587 -0.016692 8 -0.575247 0.254161 -1.143704 0.215897 9 1.193555 -0.077118 -0.408530 -0.862495 """ pieces = [df[:3], df[3:7], df[7:]] pd.concat(pieces) """ 0 1 2 3 0 -0.548702 1.467327 -1.015962 -0.483075 1 1.637550 -1.217659 -0.291519 -1.745505 2 -0.263952 0.991460 -0.919069 0.266046 3 -0.709661 1.669052 1.037882 -1.705775 4 -0.919854 -0.042379 1.247642 -0.009920 5 0.290213 0.495767 0.362949 1.548106 6 -1.131345 -0.089329 0.337863 -0.945867 7 -0.932132 1.956030 0.017587 -0.016692 8 -0.575247 0.254161 -1.143704 0.215897 9 1.193555 -0.077118 -0.408530 -0.862495 """
join 合并：
left = pd.DataFrame({'key': ['foo', 'foo'], 'lval': [1, 2]})
right = pd.DataFrame({'key': ['foo', 'foo'], 'rval': [4, 5]})
pd.merge(left, right, on='key')
"""
key lval rval
0 foo 1 4
1 foo 1 5
2 foo 2 4
3 foo 2 5
"""
追加
在 dataframe 数据后追加行
df = pd.DataFrame(np.random.randn(8, 4), columns=['A','B','C','D']) s = df.iloc[3] df.append(s, ignore_index=True)
分组
分组常常意味着可能包含以下的几种的操作中一个或多个
- 依据一些标准分离数据
- 对组单独地应用函数
- 将结果合并到一个数据结构中
df = pd.DataFrame({'A' : ['foo', 'bar', 'foo', 'bar',
'foo', 'bar', 'foo', 'foo'],
'B' : ['one', 'one', 'two', 'three',
'two', 'two', 'one', 'three'],
'C' : np.random.randn(8),
'D' : np.random.randn(8)})
# 对单个分组应用函数，数据被分成了 bar 组与 foo 组，分别计算总和。
df.groupby('A').sum()
# 依据多个列分组会构成一个分级索引
df.groupby(['A','B']).sum()
"""
C D
A B
bar one -1.814470 2.395985
three -0.595447 0.166599
two -0.392670 -0.136473
foo one -1.195665 -0.616981
three 1.928123 -1.623033
two 2.414034 1.600434
"""
数据透视表
df = pd.DataFrame({'A' : ['one', 'one', 'two', 'three'] * 3,
'B' : ['A', 'B', 'C'] * 4,
'C' : ['foo', 'foo', 'foo', 'bar', 'bar', 'bar'] * 2,
'D' : np.random.randn(12),
'E' : np.random.randn(12)})
# 生成数据透视表
pd.pivot_table(df, values='D', index=['A', 'B'], columns=['C'])
"""
C bar foo
A B
one A -0.773723 1.418757
B -0.029716 -1.879024
C -1.146178 0.314665
three A 1.006160 NaN
B NaN -1.035018
C 0.648740 NaN
two A NaN 0.100900
B -1.170653 NaN
C NaN 0.536826
"""
时间序列
pandas 拥有既简单又强大的频率变换重新采样功能，下面的例子从 1次/秒 转换到了 1次/5分钟：
rng = pd.date_range('1/1/2012', periods=100, freq='S')
ts = pd.Series(np.random.randint(0, 500, len(rng)), index=rng)
ts.resample('5Min', how='sum')
"""
2012-01-01 25083
Freq: 5T, dtype: int32
"""
# 本地化时区表示
rng = pd.date_range('3/6/2012 00:00', periods=5, freq='D')
ts = pd.Series(np.random.randn(len(rng)), rng)
"""
2012-03-06 0.464000
2012-03-07 0.227371
2012-03-08 -0.496922
2012-03-09 0.306389
2012-03-10 -2.290613
Freq: D, dtype: float64
"""
ts_utc = ts.tz_localize('UTC')
"""
2012-03-06 00:00:00+00:00 0.464000
2012-03-07 00:00:00+00:00 0.227371
2012-03-08 00:00:00+00:00 -0.496922
2012-03-09 00:00:00+00:00 0.306389
2012-03-10 00:00:00+00:00 -2.290613
Freq: D, dtype: float64
"""
# 转换为周期
ps = ts.to_period()
# 转换为时间戳
ps.to_timestamp()
分类
df = pd.DataFrame({"id":[1,2,3,4,5,6], "raw_grade":['a', 'b', 'b', 'a', 'a', 'e']})
# 将 raw_grades 转换成 Categoricals 类型
df["grade"] = df["raw_grade"].astype("category")
df["grade"]
"""
0 a
1 b
2 b
3 a
4 a
5 e
Name: grade, dtype: category
Categories (3, object): [a, b, e]
"""
# 重命名分类
df["grade"] = df["grade"].cat.set_categories(["very bad", "bad", "medium", "good", "very good"])
# 根据分类的顺序对数据进行排序
df.sort("grade")
"""
id raw_grade grade
5 6 e very bad
1 2 b good
2 3 b good
0 1 a very good
3 4 a very good
4 5 a very good
"""
作图
ts = pd.Series(np.random.randn(1000), index=pd.date_range('1/1/2000', periods=1000))
ts = ts.cumsum()
ts.plot()
数据IO
# 从 csv 文件读取数据
pd.read_csv('foo.csv')
# 保存到 csv 文件
df.to_csv('foo.csv')
# 读取 excel 文件
pd.read_excel('foo.xlsx', 'Sheet1', index_col=None, na_values=['NA'])
# 保存到 excel 文件
df.to_excel('foo.xlsx', sheet_name='Sheet1')
总结
以上就是这篇文章的全部内容了，希望本文的内容对大家学习或者使用python能带来一定的帮助，如果有疑问大家可以留言交流。
