python 读取DICOM头文件的实例

yipeiwu_com5年前Python基础

用dicompyler软件打开dicom图像,头文件如图所示:

当然也可以直接读取:

ds = dicom.read_file('H:\Data\data\\21662\\2.16.840.1.113662.2.0.105002416.1489146183.701\CT\\CT#0#21662#E7AB693D.dcm')
print ds
>>
(0008, 0008) Image Type       CS: ['ORIGINAL', 'SECONDARY', 'AXIAL']
(0008, 0016) SOP Class UID      UI: CT Image Storage
(0008, 0018) SOP Instance UID     UI: 2.16.840.1.113662.2.0.105002416.1489146183.501.0
(0008, 0020) Study Date       DA: '20170310'
(0008, 0021) Series Date       DA: '20170310'
(0008, 0023) Content Date      DA: '20060505'
(0008, 0030) Study Time       TM: '1942'
(0008, 0031) Series Time       TM: '1942'
(0008, 0033) Content Time      TM: ''
(0008, 0050) Accession Number     SH: '63071'
(0008, 0060) Modality       CS: 'CT'
(0008, 0070) Manufacturer      LO: 'NOMOS'
(0008, 0090) Referring Physician's Name   PN: ''
(0008, 1010) Station Name      SH: ''
(0008, 1090) Manufacturer's Model Name   LO: 'CORVUS 6.4'
(0010, 0010) Patient's Name      PN: '*M32-2^CHENJUN^^^'
(0010, 0020) Patient ID       LO: '21662'
(0010, 0030) Patient's Birth Date    DA: ''
(0010, 0040) Patient's Sex      CS: ''
(0018, 0050) Slice Thickness      DS: '4.75'
(0018, 0060) KVP         DS: '0'
(0018, 1020) Software Version(s)     LO: 'CORVUS 6.4'
(0018, 5100) Patient Position     CS: 'HFS'
(0020, 000d) Study Instance UID     UI: 2.16.840.1.113662.2.0.105002416.1489146183.701
(0020, 000e) Series Instance UID     UI: 2.16.840.1.113662.2.0.105002416.1489146183.501
(0020, 0010) Study ID       SH: '63071'
(0020, 0011) Series Number      IS: '0'
(0020, 0012) Acquisition Number     IS: '0'
(0020, 0013) Instance Number      IS: '0'
(0020, 0020) Patient Orientation     CS: ['L', 'P']
(0020, 0032) Image Position (Patient)   DS: ['0.73437356948853', '0', '3.25']
(0020, 0037) Image Orientation (Patient)   DS: ['1', '0', '0', '0', '1', '0']
(0020, 0052) Frame of Reference UID    UI: 2.16.840.1.113662.2.0.105002416.1489146183.601
(0020, 0060) Laterality       CS: ''
(0020, 1040) Position Reference Indicator  LO: ''
(0020, 1041) Slice Location      DS: '3.25'
(0028, 0002) Samples per Pixel     US: 1
(0028, 0004) Photometric Interpretation   CS: 'MONOCHROME2'
(0028, 0010) Rows        US: 330
(0028, 0011) Columns        US: 339
(0028, 0030) Pixel Spacing      DS: ['0.734375', '0.734375']
(0028, 0100) Bits Allocated      US: 16
(0028, 0101) Bits Stored       US: 12
(0028, 0102) High Bit       US: 11
(0028, 0103) Pixel Representation    US: 0
(0028, 1052) Rescale Intercept     DS: '-1024'
(0028, 1053) Rescale Slope      DS: '1'
(7fe0, 0010) Pixel Data 

发现一套图的第一张和最后一张的Slice Thickness往往和中间层的值是不同的。

Path = 'H:\Data\data\\21662\\2.16.840.1.113662.2.0.105002416.1489146183.701\CT\\a.dcm'
slices = dicom.read_file(path)
spacing = slices.PixelSpacing

读取头文件信息方法:

Slices.上图头文件中的name列。

这时要注意的是,name大小写不变,去掉空格,去掉符号,比如括号。

举例:

origin = slices.SoftwareVersions
print origin
>>CORVUS 6.4
spacing = slices[1].PixelSpacing
print spacing
>>['0.734375', '0.734375']

以上这篇python 读取DICOM头文件的实例就是小编分享给大家的全部内容了,希望能给大家一个参考,也希望大家多多支持【听图阁-专注于Python设计】。

相关文章

pandas 数据索引与选取的实现方法

我们对 DataFrame 进行选择,大抵从这三个层次考虑:行列、区域、单元格。 其对应使用的方法如下: 一. 行,列 --> df[] 二. 区域   --...

python实现NB-IoT模块远程控制

本来想尝试下如果不使用运营商网络应用平台情况下,只是在服务商服务器上是否可以实现对终端完全控制,如果这样可行,那么物联网应用服务端更有灵活性。实际情况下,很难实现和运营商网络对等的处理,...

Python中的heapq模块源码详析

Python中的heapq模块源码详析

起步 这是一个相当实用的内置模块,但是很多人竟然不知道他的存在——笔者也是今天偶然看到的,哎……尽管如此,还是改变不了这个模块好用的事实 heapq 模块实现了适用于Python列表的...

pytorch常见的Tensor类型详解

Tensor有不同的数据类型,每种类型分别有对应CPU和GPU版本(HalfTensor除外)。默认的Tensor是FloatTensor,可通过torch.set_default_te...

Python 处理文件的几种方式

在这个世界上,人们每天都在用 Python 完成着不同的工作。而文件操作,则是大家最常需要解决的任务之一。使用 Python,你可以轻松为他人生成精美的报表,也可以用短短几行代码快速解析...