对python读取CT医学图像的实例详解

yipeiwu_com5年前Python基础

需要安装OpenCV和SimpleItk。

SimpleItk比较简单,直接pip install SimpleItk即可。

代码如下:

#coding:utf-8
import SimpleITK as sitk
import cv2
 
#LKDS-00058,-102.655469971,108.188810974,438.759994507,12.2279986879
if __name__ == '__main__':
  filename = "F:/cancer_solution/data/train_subset00/LKDS-00058.mhd"
  ds = sitk.ReadImage(filename)
  img_array = sitk.GetArrayFromImage(ds)
  frame_num, width, height = img_array.shape
 
  outpath = "F:/cancer_solution/out/train/LKDS-00058"
  index = -1
  for img_item in img_array:
    index = index + 1
    cv2.imwrite("%s/%d.png"%(outpath,index),img_item)
 
  print "done!"

如上所示,就将CT影像解析成了多个单幅图片。

python读取CT医学图像

python读取CT医学图像

目前还不太理解(x,y,z)坐标是如何对应的。

但祈世间人无病,何愁架上药生尘。癌症,终有一天可以被战胜。

以上这篇对python读取CT医学图像的实例详解就是小编分享给大家的全部内容了,希望能给大家一个参考,也希望大家多多支持【听图阁-专注于Python设计】。

相关文章

在Python中使用dict和set方法的教程

在Python中使用dict和set方法的教程

dict Python内置了字典:dict的支持,dict全称dictionary,在其他语言中也称为map,使用键-值(key-value)存储,具有极快的查找速度。 举个例子,假设要...

在python3环境下的Django中使用MySQL数据库的实例

在python3环境下的Django中使用MySQL数据库的实例

我们在使用Django过程中,数据库往往是离不开的,比较长常用的是MySQL数据库,但在使用过程中,对Python不同的版本对用的库也不一样,用惯了Python2的人在使用Python3...

pytorch 改变tensor尺寸的实现

改变Tensor尺寸的操作 1.tensor.view tensor.view方法,可以调整tensor的形状,但必须保证调整前后元素总数一致。view不会改变自身数据,返回的新的ten...

linux环境下的python安装过程图解(含setuptools)

linux环境下的python安装过程图解(含setuptools)

这里我不想采用诸如ubuntu下的apt-get install方式进行python的安装,而是在linux下采用源码包的方式进行python的安装。 一、下载python源码包 打开u...

Python中关于Sequence切片的下标问题详解

前言 在python中, 切片是一个经常会使用到的语法, 不管是元组, 列表还是字符串, 一般语法就是: sequence[ilow:ihigh:step] # ihigh,step...