对python mayavi三维绘图的实现详解

yipeiwu_com5年前Python基础

网上下载mayavi的官方帮助文档,里面有很多例子,下面的记录都是查看手册后得到的。

http://code.enthought.com/projects/mayavi/docs/development/latex/mayavi/mayavi_user_guide.pdf

python的mayavi.mlab库中的绘图函数有很多候选参数,但下文记录并没有过多讨论,本人也是需要用到才查看手册的。

安装好mayavi2的绘图环境后,可以结合numpy进行科学绘图,在代码中事先加入如下代码:

  import mayavi.mlab as mlab
  from numpy import exp,sin,cos,tan,random,mgrid,ogrid,linspace,sqrt,pi
  import numpy as np
  import matplotlib.pyplot as plt
  mlab.figure(fgcolor=(0, 0, 0), bgcolor=(1, 1, 1)) #更改背景色
  #添加matlab的peaks函数
  def peaks(x,y):
    return 3.0*(1.0-x)**2*exp(-(x**2) - (y+1.0)**2) - 10*(x/5.0 - x**3 - y**5) * exp(-x**2-y**2) - 1.0/3.0*exp(-(x+1.0)**2 - y**2)

首先从帮助手册上了解下mayavi的colormap,如下图:

python mayavi三维绘图

下面列举常用的三维绘图函数和简单例子。

一、barchart

* barchart(s, ...)
* barchart(x, y, s, ...)
* barchart(x, y, f, ...)
* barchart(x, y, z, s, ...)
* barchart(x, y, z, f, ...)

如果只传递一个参数,可以是一维(1-D),二维(2-D)或3维(3-D)的给定向量长度的数组;

如果传递三个参数(x,y,s)或(x,y,f),x,y是对应于数组s的二维(2-D)坐标,也可以是可调用的函数f,该函数返回数组;

四个参数的时候(x,y,z)表示三维坐标

  s = np.random.rand(3,3)
  mlab.barchart(s)
  mlab.vectorbar()
  mlab.show()

python mayavi三维绘图

 x,y = np.mgrid[-5:5:20j,-5:5:20j]
  s = peaks(x,y)   #peaks函数前面已经定义
  mlab.barchart(x,y,s)
  mlab.vectorbar()
  mlab.show()

python mayavi三维绘图

二、contour3d

* contour3d(scalars, ...)
* contour3d(x, y, z, scalars, ...)
* contour3d(x, y, z, f, ...)

scalars是三维数组(3-D),x,y,z用numpy.mgrid生成,是三维数组

  x, y, z = ogrid[-5:5:64j, -5:5:64j, -5:5:64j]
  scalars = x * x * 0.5 + y * y + z * z * 2.0
  mlab.contour3d(scalars, contours=6, transparent=True)
  mlab.colorbar()
  mlab.show()

python mayavi三维绘图

三、contour_surf

* contour_surf(s, ...)
* contour_surf(x, y, s, ...)
* contour_surf(x, y, f, ...)

s是二维数组,f是可调用的函数,例如peaks函数

x and y can be 1D or 2D arrays (such as returned by numpy.ogrid or numpy.mgrid)

  x,y = np.mgrid[-5:5:70j,-5:5:70j]
  #绘制peaks函数的等高线
  mlab.contour_surf(x,y,peaks,contours=9)
  mlab.colorbar()
  mlab.show()

python mayavi三维绘图

四、imshow

* imshow(s, ...)

s is a 2 dimension array. The values of s are mapped to a color using the colormap.

  s = np.random.rand(3,3) #生成随机的3×3数组
  mlab.imshow(s)
  mlab.colorbar()
  mlab.show()

python mayavi三维绘图

五、mesh

* mesh(x, y, z, ...)

x, y, z are 2D arrays, all of the same shape, giving the positions of the vertices of the surface.

x , y , z 都是二维数组,拥有相同的shape,而且z代表了平面坐标(x,y)对应下的值,下面绘制的是matlab的peaks函数三维图,可能是因为绘图比例的原因看起来并没有matlab下绘制的好看

  y,x = np.mgrid[-5:5:70j,-5:5:70j]
  z=peaks(x,y)
  mlab.mesh(x,y,z)
  mlab.colorbar()
  mlab.show()

python mayavi三维绘图

六、surf

* surf(s, ...)
* surf(x, y, s, ...)
* surf(x, y, f, ...)

x , y可以是1-D或者2-D的数组(比如numpy.ogrid或numpy.mgrid返回的数组)

如果只传递了参数数组s,那么x,y就被认为是数组s的索引值,并且创建等宽的数据集。(If only 1 array s is passed, the x and y arrays are assumed to be made from the indices of arrays, and an uniformly-spaced data set is created.)

surf和mesh的不同之处在于surf的参数x,y可以是一维(1-D)的。

  mlab.clf()
  x, y = mgrid[-10:10:100j, -10:10:100j]
  r = sqrt(x**2 + y**2)
  z = sin(r)/r
  # mlab.surf(x,y,z,wrap_scale='auto')
  mlab.surf(z, warp_scale='auto')
  mlab.colorbar()
  mlab.show()

python mayavi三维绘图

surf函数同样可以绘制peaks曲面,

  pk_y,pk_x = np.mgrid[-5:5:70j,-5:5:70j]
  pk_z=peaks(pk_x,pk_y)
  mlab.surf(pk_z,warp_scale='auto',colormap='jet')
  mlab.colorbar()
  mlab.show()

这里只传递了一个参数pk_z,

python mayavi三维绘图

七、plot3d

* plot3d(x, y, z, ...)
* plot3d(x, y, z, s, ...)

数据点之间绘制线段,x,y,z,s都是具有相同shape的numpy数组或列表(list),x,y,z是三维坐标,也就是空间中数据点的位置

  t=mgrid[-pi:pi:100j]
  mlab.plot3d(cos(t),sin(3*t),cos(5*t),color=(0.23,0.6,1),colormap='Spectral')
  mlab.colorbar()
  mlab.show()

python mayavi三维绘图

八、points3d

* points3d(x, y, z...)
* points3d(x, y, z, s, ...)
* points3d(x, y, z, f, ...)

和前面的plot3d差不多,只不过points3d只绘制三维坐标下的点(x,y,z),仍然用前面的例子。

  t=mgrid[-pi:pi:50j]
  s=sin(t)
  # 参数s是设置每个点的大小(scalar),mode可选
  mlab.points3d(cos(t),sin(3*t),cos(5*t),s,mode='sphere',line_width=1)
  mlab.colorbar()
  mlab.show()

python mayavi三维绘图

参数的mode可选项如下图:

python mayavi三维绘图

九、quiver3d

* quiver3d(u, v, w, ...)
* quiver3d(x, y, z, u, v, w, ...)
* quiver3d(x, y, z, f, ...)

  x,y,z=mgrid[-0:3:0.6,-0:3:0.6,0:3:0.3]
  r=sqrt(x**2+y**2+z**4)
  u=y*sin(r)/(r+0.001)
  v=-x*sin(r)/(r+0.001)
  w=zeros_like(r)
  mlab.quiver3d(x,y,z,u,v,w)
  mlab.colorbar()
  mlab.show()

python mayavi三维绘图

十、animate

绘制三维动图,帮助文档上的代码执行后并没有动画效果,下面2个示例代码是查看了mayavi的相关源码后总结的,大家也可以直接查看相关源码查看更多官方提供的示例代码。

(1)

  @animate(delay=200) # 设置延时时间200ms
  def anim():
    n_mer, n_long = 6, 11
    pi = numpy.pi
    dphi = pi/1000.0
    phi = numpy.arange(0.0, 2 * pi + 0.5 * dphi, dphi, 'd')
    mu = phi * n_mer
    x = numpy.cos(mu) * (1+numpy.cos(n_long * mu/n_mer) * 0.5)
    y = numpy.sin(mu) * (1+numpy.cos(n_long * mu/n_mer) * 0.5)
    z = numpy.sin(n_long * mu/n_mer) * 0.5
    l = plot3d(x, y, z, numpy.sin(mu), tube_radius=0.025, colormap='Spectral')
    ms = l.mlab_source
    for i in range(100):
      x = numpy.cos(mu) * (1+numpy.cos(n_long * mu/n_mer + numpy.pi * (i+1)/5.) * 0.5)
      scalars = numpy.sin(mu + numpy.pi * (i+1)/5)
      #不改变shape和size的情况下用set来更改属性值
        ms.set(x=x, scalars=scalars)  
      yield
  anim()
  show()

(2)

  @animate #默认500ms延时
  def anim2():
    x, y = np.mgrid[0:3:1,0:3:1]
    s = mlab.surf(x, y, np.asarray(x*0.1, 'd'),representation='wireframe')
    fig = mlab.gcf()
    ms = s.mlab_source
    for i in range(15):
      x, y = np.mgrid[0:3:1.0/(i+2),0:3:1.0/(i+2)]
      sc = np.asarray(x*x*0.05*(i+1), 'd')
      ms.reset(x=x, y=y, scalars=sc)
      fig.scene.reset_zoom()
      yield
  anim2()
  show()

以上这篇对python mayavi三维绘图的实现详解就是小编分享给大家的全部内容了,希望能给大家一个参考,也希望大家多多支持【听图阁-专注于Python设计】。

相关文章

Selenium 模拟浏览器动态加载页面的实现方法

相信爬取大公司的数据时,常常会遇到页面信息动态加载的问题, 如果仅仅使用content = urllib2.urlopen(URL).read(),估计信息是获取不全的,这时候就需要模拟...

python 遍历目录(包括子目录)下所有文件的实例

如下所示: def list_all_files(rootdir): import os _files = [] list = os.listdir(rootdir) #列出文...

Python中工作日类库Busines Holiday的介绍与使用

Python中工作日类库Busines Holiday的介绍与使用

引言 大家在日常工作中,经常会碰到类似的场景,需要计算在某个时间段内的工作日以及确定某天是否为工作日,这里的介绍的工具包将很好的解决这个问题。 1. 工具包Business Holid...

tensorflow学习教程之文本分类详析

tensorflow学习教程之文本分类详析

前言 这几天caffe2发布了,支持移动端,我理解是类似单片机的物联网吧应该不是手机之类的,试想iphone7跑CNN,画面太美~ 作为一个刚入坑的,甚至还没入坑的人,咱们还是老实研究...

python3+PyQt5泛型委托详解

python3+PyQt5泛型委托详解

自定义委托可以让我们对视图中出现的数据项的外观和行为进行完全控制。如果有很多模型,可能会希望不是全部的大多数模型能够仅用一个自定义委托,如果不能这么做,那么对于这些自定义委托,将很有可能...