Python实现简单层次聚类算法以及可视化

yipeiwu_com5年前Python基础

本文实例为大家分享了Python实现简单层次聚类算法,以及可视化,供大家参考,具体内容如下

基本的算法思路就是:把当前组间距离最小的两组合并成一组。

算法的差异在算法如何确定组件的距离,一般有最大距离,最小距离,平均距离,马氏距离等等。

代码如下:

import numpy as np
import data_helper
np.random.seed(1)
def get_raw_data(n):
 _data=np.random.rand(n,2)
 #生成数据的格式是n个(x,y)
 _groups={idx:[[x,y]] for idx,(x,y) in enumerate(_data)}
 return _groups
def cal_distance(cluster1,cluster2):
 #采用最小距离作为聚类标准
 _min_distance=10000
 for x1,y1 in cluster1:
  for x2,y2 in cluster2:
   _distance=(x1-x2)**2+(y1-y2)**2
   if _distance<_min_distance:
    _min_distance=_distance
 return _distance
groups=get_raw_data(10)
count=0
while len(groups)!=1:#判断是不是所有的数据是不是归为了同一类
 min_distance=10000
 len_groups=len(groups)
 
 for i in groups.keys():
  for j in groups.keys():
   if i>=j:
    continue
   distance=cal_distance(groups[i],groups[j])
   if distance<min_distance:
    min_distance=distance
    min_i=i
    min_j=j#这里的j>i
 groups[min_i].extend(groups.pop(min_j))
 data_helper.draw_data(groups)
 #一共n个簇,共迭代n-1次

运行的效果就是迭代一次,组数就会少一次,调用画图方法,同一组的数据被显示为一个颜色。

以上就是本文的全部内容,希望对大家的学习有所帮助,也希望大家多多支持【听图阁-专注于Python设计】。

相关文章

Python中的XML库4Suite Server的介绍

在继续阅读本文之前,您务必要对我们在本专栏中将要讨论的一些技术有所了解。我们要使用的技术包括:可扩展的样式表语言转换(Extensible Stylesheet Language Tra...

python中的反斜杠问题深入讲解

前言 python本身使用 \ 来转义一些特殊字符,比如在字符串中加入引号的时候 s = 'i\'m superman' print(s) # i'm superman 为了防止和...

Python wxpython模块响应鼠标拖动事件操作示例

Python wxpython模块响应鼠标拖动事件操作示例

本文实例讲述了Python wxpython模块响应鼠标拖动事件操作。分享给大家供大家参考,具体如下: wxpython鼠标拖动事件小案例: #coding:UTF-8 import...

python使用Flask操作mysql实现登录功能

python使用Flask操作mysql实现登录功能

用到的一些知识点:Flask-SQLAlchemy、Flask-Login、Flask-WTF、PyMySQL 这里通过一个完整的登录实例来介绍,程序已经成功运行,在未登录时拦截了suc...

TensorFlow 模型载入方法汇总(小结)

TensorFlow 模型载入方法汇总(小结)

一、TensorFlow常规模型加载方法 保存模型 tf.train.Saver()类,.save(sess, ckpt文件目录)方法 参数名称...