python 将dicom图片转换成jpg图片的实例

yipeiwu_com7年前Python基础

主要原理:调整dicom的窗宽,使之各个像素点上的灰度值缩放至[0,255]范围内。

使用到的python库:SimpleITK

下面是一个将dicom(.dcm)图片转换成jpg图片的demo:

import SimpleITK as sitk
import numpy as np
import cv2

def convert_from_dicom_to_jpg(img,low_window,high_window,save_path):
  lungwin = np.array([low_window*1.,high_window*1.])
  newimg = (img-lungwin[0])/(lungwin[1]-lungwin[0])  #归一化
  newimg = (newimg*255).astype('uint8')        #将像素值扩展到[0,255]
  cv2.imwrite(save_path, newimg, [int(cv2.IMWRITE_JPEG_QUALITY), 100])

if __name__ == '__main__':

  # 下面是将对应的dicom格式的图片转成jpg
  dcm_image_path = '/DICOM_image/lung001.dcm'    #读取dicom文件
  output_jpg_path = 'JPG_image/lung001.jpg'
  ds_array = sitk.ReadImage(dcm_image_path)     #读取dicom文件的相关信息
  img_array = sitk.GetArrayFromImage(ds_array)   #获取array
  # SimpleITK读取的图像数据的坐标顺序为zyx,即从多少张切片到单张切片的宽和高,此处我们读取单张,因此img_array的shape
  #类似于 (1,height,width)的形式
  shape = img_array.shape
  img_array = np.reshape(img_array, (shape[1], shape[2])) #获取array中的height和width
  high = np.max(img_array)
  low = np.min(img_array)
  convert_from_dicom_to_jpg(img_array, low, high, output_jpg_path)  #调用函数,转换成jpg文件并保存到对应的路径
  print('FINISHED')

以上这篇python 将dicom图片转换成jpg图片的实例就是小编分享给大家的全部内容了,希望能给大家一个参考,也希望大家多多支持【听图阁-专注于Python设计】。

相关文章

Anaconda入门使用总结

Anaconda入门使用总结

序 Python易用,但用好却不易,其中比较头疼的就是包管理和Python不同版本的问题,特别是当你使用Windows的时候。为了解决这些问题,有不少发行版的Python,比如WinPy...

flask框架路由常用定义方式总结

本文实例讲述了flask框架路由常用定义方式。分享给大家供大家参考,具体如下: 路由的各种定义方式 请求方式限定 使用 methods 参数指定可接受的请求方式,可以是多种 @app...

使用python Telnet远程登录执行程序的方法

如下所示: # -*-coding:utf-8 -*- def do_telnet(Host, username, password, finish, commands):...

python对象与json相互转换的方法

在网络通信中,json是一种常用的数据格式,对于python来讲,将类转化为json数据以及将json数据转化为对象是一件非常容易的事情。 下面给出两者转化的方法 # -*- cod...

浅析python中SQLAlchemy排序的一个坑

前言 SQLAlchemy是Python编程语言下的一款ORM框架,该框架建立在数据库API之上,使用关系对象映射进行数据库操作,简言之便是:将对象转换成SQL,然后使用数据API执行S...