python 将dicom图片转换成jpg图片的实例

yipeiwu_com6年前Python基础

主要原理:调整dicom的窗宽,使之各个像素点上的灰度值缩放至[0,255]范围内。

使用到的python库:SimpleITK

下面是一个将dicom(.dcm)图片转换成jpg图片的demo:

import SimpleITK as sitk
import numpy as np
import cv2

def convert_from_dicom_to_jpg(img,low_window,high_window,save_path):
  lungwin = np.array([low_window*1.,high_window*1.])
  newimg = (img-lungwin[0])/(lungwin[1]-lungwin[0])  #归一化
  newimg = (newimg*255).astype('uint8')        #将像素值扩展到[0,255]
  cv2.imwrite(save_path, newimg, [int(cv2.IMWRITE_JPEG_QUALITY), 100])

if __name__ == '__main__':

  # 下面是将对应的dicom格式的图片转成jpg
  dcm_image_path = '/DICOM_image/lung001.dcm'    #读取dicom文件
  output_jpg_path = 'JPG_image/lung001.jpg'
  ds_array = sitk.ReadImage(dcm_image_path)     #读取dicom文件的相关信息
  img_array = sitk.GetArrayFromImage(ds_array)   #获取array
  # SimpleITK读取的图像数据的坐标顺序为zyx,即从多少张切片到单张切片的宽和高,此处我们读取单张,因此img_array的shape
  #类似于 (1,height,width)的形式
  shape = img_array.shape
  img_array = np.reshape(img_array, (shape[1], shape[2])) #获取array中的height和width
  high = np.max(img_array)
  low = np.min(img_array)
  convert_from_dicom_to_jpg(img_array, low, high, output_jpg_path)  #调用函数,转换成jpg文件并保存到对应的路径
  print('FINISHED')

以上这篇python 将dicom图片转换成jpg图片的实例就是小编分享给大家的全部内容了,希望能给大家一个参考,也希望大家多多支持【听图阁-专注于Python设计】。

相关文章

python按键按住不放持续响应的实例代码

在学习飞机大战(我也不知道为什么都拿这个练手),飞机左右控制都是按键按一次移动一次,不能按住一个键后持续移动,离开后停止移动。 为了解决这个,查看了参考手册,说让用pygame.key....

Python内置函数 next的具体使用方法

Python 3中的File对象不支持next()方法。 Python 3有一个内置函数next(),它通过调用其next ()方法从迭代器中检索下一个项目。 如果给定了默认值,则在迭代...

对Django 中request.get和request.post的区别详解

Django 中request.get和request.post的区别 POST和GET差异: POST和GET是HTTP协议定义的与服务器交互的方法。GET一般用于获取/查询资源信息,...

python区分不同数据类型的方法

python区分不同数据类型的方法

python怎么区分不同数据类型? Python判断变量的数据类型的两种方法 一、Python中的数据类型有数字、字符串,列表、元组、字典、集合等。有两种方法判断一个变量的数据类型 1、...

Python如何使用k-means方法将列表中相似的句子归类

Python如何使用k-means方法将列表中相似的句子归类

前言 由于今年暑假在学习一些自然语言处理的东西,发现网上对k-means的讲解不是很清楚,网上大多数代码只是将聚类结果以图片的形式呈现,而不是将聚类的结果表示出来,于是我将老师给的代码和...