python 将dicom图片转换成jpg图片的实例

yipeiwu_com7年前Python基础

主要原理:调整dicom的窗宽,使之各个像素点上的灰度值缩放至[0,255]范围内。

使用到的python库:SimpleITK

下面是一个将dicom(.dcm)图片转换成jpg图片的demo:

import SimpleITK as sitk
import numpy as np
import cv2

def convert_from_dicom_to_jpg(img,low_window,high_window,save_path):
  lungwin = np.array([low_window*1.,high_window*1.])
  newimg = (img-lungwin[0])/(lungwin[1]-lungwin[0])  #归一化
  newimg = (newimg*255).astype('uint8')        #将像素值扩展到[0,255]
  cv2.imwrite(save_path, newimg, [int(cv2.IMWRITE_JPEG_QUALITY), 100])

if __name__ == '__main__':

  # 下面是将对应的dicom格式的图片转成jpg
  dcm_image_path = '/DICOM_image/lung001.dcm'    #读取dicom文件
  output_jpg_path = 'JPG_image/lung001.jpg'
  ds_array = sitk.ReadImage(dcm_image_path)     #读取dicom文件的相关信息
  img_array = sitk.GetArrayFromImage(ds_array)   #获取array
  # SimpleITK读取的图像数据的坐标顺序为zyx,即从多少张切片到单张切片的宽和高,此处我们读取单张,因此img_array的shape
  #类似于 (1,height,width)的形式
  shape = img_array.shape
  img_array = np.reshape(img_array, (shape[1], shape[2])) #获取array中的height和width
  high = np.max(img_array)
  low = np.min(img_array)
  convert_from_dicom_to_jpg(img_array, low, high, output_jpg_path)  #调用函数,转换成jpg文件并保存到对应的路径
  print('FINISHED')

以上这篇python 将dicom图片转换成jpg图片的实例就是小编分享给大家的全部内容了,希望能给大家一个参考,也希望大家多多支持【听图阁-专注于Python设计】。

相关文章

Django使用 Bootstrap 样式修改书籍列表过程解析

Django使用 Bootstrap 样式修改书籍列表过程解析

展示书籍列表: 首先修改原先的 book_list.html 的代码: <!DOCTYPE html> <!-- saved from url=(0042)htt...

python海龟绘图实例教程

本文以实例形式介绍了python turtle模块即海龟绘图的使用方法,对于需要进行图形编程的朋友相信会有一定的借鉴价值。 python turtle模块简介:  python...

Pytorch之view及view_as使用详解

view()函数是在torch.Tensor.view()下的一个函数,可以有tensor调用,也可以有variable调用。 其作用在于返回和原tensor数据个数相同,但size不同...

python3使用matplotlib绘制条形图

python3使用matplotlib绘制条形图

本文实例为大家分享了python3使用matplotlib绘制条形图的具体代码,供大家参考,具体内容如下 绘制竖状条形图 代码 from matplotlib import pyp...

Python实现字符串逆序输出功能示例

本文实例讲述了Python实现字符串逆序输出功能。分享给大家供大家参考,具体如下: 1、有时候我们可能想让字符串倒序输出,下面给出几种方法 方法一:通过索引的方法 >>&...